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Zur Darstellung der Chromosomenfeinstruktur erfolgt die Anfärbung mit speziellen Kernfarbstoffen, vor allem Giemsa (G-Bandenfärbung) oder dem Fluoreszenzfarbstoff Quinacrin (Q-Bandenfärbung). Durch die verschiedenen Färbemethoden können auch kleine morphologische Veränderungen an den Chromosomen erkannt werden. Mittels mikrophotographischer Wiedergabe können Chromosomenkarten (Karyogramm, Karyotypisierung) angefertigt werden.

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